風邪をひいたときの診察で、舌の奥をヘラみたいなもので押されて「オエッ」となりそうな経験をしたことがあると思います。 これを咽頭反射（いんとうはんしゃ）と言いますが、口から内視鏡を入れる場合は、多少なりともこうした咽頭反射が起こります。 ところが、鼻から入れる場合は内視鏡が舌の根元に触れないので、ほとんど吐き気をもよおすことなく検査を受けることができます。

口から内視鏡を入れると、口がふさがってしまうために検査中はお話ができません。 しかし、鼻から入れる場合は口を自由に動かせますので、検査をしている医師と 「痛くありませんか？」 「はい、大丈夫です」 というような会話ができます。 気になったことをその場で確認できるので、安心して検査を受けられます。

鼻からの内視鏡は鼻腔（びくう）へスプレーをして出血を予防し、ゼリー状の液体を流し込んで局部麻酔を行います。 麻酔に用いる薬が少量であるため、体への負担も少なく、検査終了後６０分で水を飲んだり食事をしたりできます。